Øyeren er dannet av Glomma, 84 km2. Innsjøen er regulert mellom 100,25 og 102,65 moh. Største dybde er 71 m; Glommas delta i nordøst er Nordens største innsjødelta. I nord faller Nitelva og Leira i Svellet, Øyerens grunne nordlige del, som er delt fra resten av sjøen av øyene i Glommas delta.
Berggrunnen i området består av GNEIS som tilhører Sveconorvegiske fjellkjede. Lokalt finnes diabasganger og iddefjordsgranitt.
Fra vikingtid foregikk meget betydelig tømmerfløting i Øyeren, som ble nedlagt 1985. Sagbruk fra 1530 til begynnelsen av 1900-tallet. Rutebåt 1885-1927. Det er trangt elveløp ut av sjøen. Flate, lave områder rundt nordenden av Øyeren har flere ganger medført store oversvømmelser under flom i Glomma, senest i 1995. Avløpstunnel er derfor sprengt forbi Solbergfoss, som er det øverste kraftverket nedenfor Øyeren.
Øyeren er Norges mest artsrike innsjø, idet minst 25 fiskearter er registrert. Nordre del av Øyeren er fredet som naturreservat; 62 km2. Betydelig våtmarksområde for fugl; mer enn 250 fuglearter er registrert.
Fetsund Lensemuseum i det tidligere sorteringsanlegget for tømmerfløtingen i Glomma er Akershus' best besøkte museum.
Navnet kommer av norrønt Øyir, avledet av øy; sikter til de store sandøyene i Glommas delta i nordøst.