Nålflagellater, (av gr. raphis, 'nål'), algeklasse i divisjonen Heterokontophyta, bare noen få arter. Ferskvannsarter har mange gressgrønne kloroplaster, marine arter har mange gulbrune kloroplaster. Av arter kan nevnes ferskvannsarten Gonyostomum semen, som med sine nesleorganeller kan irritere huden hos badende, og den marine arten Heterosigma akashiwo, som ved masseforekomst er giftig for fisk i oppdrett.