Organer som utvikles på noenlunde samme måte på fosterstadiet. Disse organene kan ha ulik funksjon og således, iallfall overfladisk sett, være forskjellig utformet. Eksempel: forlemmene hos menneske, hund, hest, moldvarp, flaggermus, hval, sel, fugl. Man regner med at homologe organer har felles opprinnelse hos en felles stamform i en fjern fortid.
Organer som har samme funksjon, men forskjellig bygning og opprinnelse kalles analoge organer.
Homologibetraktninger er grunnleggende innenfor sammenlignende anatomi og har stått sentralt ved utformingen av evolusjonslæren.