I prinsippet er skolen obligatorisk i Burkina Faso for barn i alderen 6-16 år med 6-årig grunnskole. Men skoleplikten blir ikke håndhevet, slik at bare ca. 40 % av barn i grunnskolealder går i skolen og ca. 8 % av de aktuelle årsklassene går i videregående skole. Det er store variasjoner mellom de ulike regionene i landet.
Undervisningsspråket er fransk. Alfabetiseringsprogrammer på nasjonale språk er vanskelige å gjennomføre, fordi av ca. 60 språk er bare 14 skriftspråk. Ca. 76 % av befolkningen beregnes å være analfabeter, av kvinnene i overkant av 90 % (2000).
Det ble opprettet universitet i Ouagadougou i 1974.