Etter mange år med militært styre fikk Nigeria 1999 en ny grunnlov og en fredelig overgang til sivilt styre. Samtidig ble det valgt ny president. Statsoverhodet, presidenten, velges i allmenne valg for fire år med muligheter for ett gjenvalg. Presidenten er også regjeringssjef og militær øverstkommanderende. Den lovgivende forsamling har to kammer. Senatet består av 109 medlemmer; tre fra hver av delstatene pluss en fra hovedstaden Abuja. Representantenes hus har 346 medlemmer. Begge kamre velges i allmenne valg for fire år.
Etniske og religiøse spenninger, svingende konjunkturer i et oljeavhengig land, utbredt korrupsjon, høy kriminalitet i byene og et forsvar som stadig griper inn i politikken, har gjort det nigerianske politiske system svært ustabilt.
Administrativ inndeling
Nigeria er delt inn i 36 stater samt hovedstadsområdet. De er igjen inndelt i 774 kommuner. Delstatene har egne folkevalgte forsamlinger og styres av folkevalgte guvernører.