8-årig grunnskole er gratis og obligatorisk for alle i alderen 7–15 år. I 2000 gikk ca. 93 % av barna i grunnskolen. Det finnes ulike typer 4-årige videregående skoler, og vel 80 % av de unge tar videregående skole. Grunnloven garanterer undervisning på morsmålet, og det finnes skoler med både albansk og serbisk som undervisningsspråk. Det er universitet i Skopje (grunnlagt 1949) og i Bitola (1979). I 2001 åpnet et privat, albanskspråklig universitet i Tetovo, som fra 2004 er statlig.