Filippinene ligger i den tropiske klimasone og har et temmelig ensartet klima. Temperaturene er vanligvis overalt omkring 26–27 °C, og årsvariasjonene er bare på 3–4 °.
De regionale klimaforskjellene skyldes nesten utelukkende fordelingen av nedbøren. De vestlige kyststrekninger har en skarpt markert tørketid og regntid.
I perioden juni–desember, da sørvestmonsunen dominerer, faller store nedbørmengder. Vinteren og våren er derimot tørketid, da disse kyststrekninger ligger i le for nordøstpassaten. På de østlige kyster er nedbørene jevnere fordelt over hele året. Mesteparten faller i forbindelse med nordøstpassaten, men i sommerhalvåret bringer også de sørlige monsunvinder regn til østkysten. Årsnedbøren varierer fra litt under 1000 mm i dalslettene (med tørketid) til 4500 mm i fjellene. Den nordlige halvdel av Filippinene er utsatt for tropiske orkaner (tyfoner), se tropisk lavtrykk.
Temperatur
| VARMESTE MÅNED | KALDESTE MÅNED | |||||
| Maks.°C | Min.°C | Maks°C | Min.°C | |||
| Manila | mai | 34 | 24 | jan. | 30 | 21 |
| Jolo | aug. | 31 | 23 | jan. | 29 | 23 |
| Zamboanga | mars | 32 | 23 | juli | 31 | 23 |
Temperaturene som oppgis er gjennomsnittlig daglig maksimum og minimum i vedkommende måned.
Nedbør
| ÅRLIG | VÅTESTE MÅNED | TØRRESTE MÅNED | |||
| mm | mm | mm | |||
| Manila | 2080 | aug. | 372 | feb. | 28 |
| Jolo | 1990 | okt. | 164 | feb. | 118 |
| Zamboanga | 1075 | sept., okt. | 118 | mars, april | 56 |