Det er allmenn verneplikt for menn fra fylte 19 år og førstegangstjeneste fra 8 til 11 måneder. Landet er medlem av NATO fra 2004. Styrketallet var i 2007 for hæren ca. 5000 (herav 2200 vernepliktige); i tillegg kommer en halvmilitær grensevakt på 2600. Hæren er lett utrustet med et lite antall pansrede personellkjøretøyer. Styrketallet for flyvåpenet var 210 med to ransport- og fire øvingsfly samt fire helikoptre. Styrketallet for marinen var 350; materiellet er bl.a. en fregatt, fem minesveipere, to mineleggere og tre patruljefartøyer. Norge har bidratt til oppbyggingen av det estiske forsvaret med materiell og militære instruktører.