Både Mbini og Bioko ligger i det tropiske regnskogsbeltet, og mottar året rundt store nedbørmengder. På fastlandet får kystsletta årlig mellom 2400 og 4600 mm nedbør med to topper i året; platået er noe tørrere. På Bioko kan nedbøren overstige 5000 mm årlig, med én nedbørtopp om sommeren. Middeltemperaturen ligger rundt 26 °C, de årlige temperaturvariasjoner er små og det er hele året en konstant høy luftfuktighet. Døgnvariasjonene er imidlertid større; døgnmaksimum er 34 °C, døgnminimum 17 °C.