Presidenten er øverste sjef for forsvaret. Det er alminnelig verneplikt i 2 år for alle menn fra fylte 17 år, mens kvinner kan melde seg for tjeneste. Styrketallene (2004) for hær, marine og flyvåpen er henholdsvis 35 000, 3000 og 8000. Av halvmilitære styrker finnes 20 000 i styrkene for indre sikkerhet, 6500 i grensevakten og 1 000 000 i folkemilitsen som en reservestyrke. Våpen og materiell stammer hovedsakelig fra gammel russisk produksjon. Marinen har fire missil-/patruljebåter og seks mineryddingsfartøyer. Flyvåpenet har 130 kampfly, men bare ca. 20 er regnet som operative. USA har ca. 2000 mann på den amerikanske flåtebasen ved Guantánamo. I 2001 forlot de siste russiske militære Cuba etter å ha vært stasjonert der siden 1960-årene.