dansk arkitekt. Han var blant de første som brakte funksjonalismens ideer til Danmark da han sammen med K. Fisker og P. Stegmann vant konkurransen om Aarhus universitet. Prosjektet var til å begynne med sterkt påvirket av Bauhaus-skolen, men bruken av gul tegl og skråtak i det ferdige anlegget viser en tilpasning av funksjonalismen til danske forhold. 1943–63 overtok Møller eneansvaret for fullføringen av universitetsutbyggingen og bygde samtidig opp et kontor med stor spennvidde i oppdragene, fra institusjoner og boliger til næringsbygg. Blant de mest originale arbeidene er fabrikken Angli (1965–66) og Carl-Henning Pedersen Museet (1975–76), begge i Herning, som med sine sirkulære bygningskropper er blant Møllers sjeldne avvik fra den funksjonelle tradisjon. Han var initiativtager til opprettelsen av Arkitektskolen i Aarhus i 1965 og var skolens første rektor. Kongelig bygningsinspektør 1953–68.
Etter Møllers død har firmaet, under navnet C. F. Møllers Tegnestue, hatt en rekke større oppdrag, som boligområdet Sandbakken i Skåde (1990), Danmarks nye nasjonalstadion i København (1992) og Statens museum for kunst i København (1997). I 1995 vant kontoret arkitektkonkurransen om byggingen av nytt Bislett stadion i Oslo, ferdig 2005.