Klimaet er tropisk, med en utpreget tørkeperiode. I sør varer tørketiden fra desember til februar, og den årlige nedbørmengde er ca. 1200 mm. Lenger mot nord blir tørketiden lengre, fra november til april, og årsnedbøren minsker. Ouagadougou får 900 mm, lengst i nord synker nedbøren til ca. 400 mm årlig. Temperaturene er høye, særlig i slutten av tørkeperioden. Ouagadougou har 33 °C i middeltemperatur i april (varmeste måned), og 25 °C i januar (kaldeste måned).