Innenfor den ca. 100 km lange kystlinjen, som for en stor del består av sandbanker og laguner, ligger det ca. 90 m høye platået Terre de Barre, et fruktbart leireområde, og Lama-senkningen, en 80-90 km bred, sumpig slette. Nord for denne senkningen ligger de fire Benin-platåene, Abomey, Parakou, Zagnanado og Kétou, ca. 90-230 moh.
I øst renner Ouémé, landets lengste elv (ca. 460 km lang) som munner ut i Guineabukta. Atakorafjellene i landets nordvestlige del danner en naturlig forlengelse av fjellene i Togo, og når opp i 641 moh.
Helt nord i Benin ligger et mindre fruktbart sandsteinsplatå med svakt fall ned mot Niger – elv, som danner en del av Benins grense mot nabolandet Niger. Flere nasjonalparker i nord.