består av en rekke typer spesialiserte celler, bl.a lymfocytter, plasmaceller og makrofager, som finnes spredt i kroppen og spesielt i milten, thymus, lymfeknuter, benmarg og lymfoid vev i tarmkanalen.
Immunsystemet beskytter mot sykdom ved å angripe og tilintetgjøre mikroorganismer og makromolekyler som er fremmede for kroppen. Immunsystemet kan også være årsak til sykdom ved at det angriper kroppens egne celler og vev (autoimmune sykdommer) eller transplantater (avstøtningsreaksjoner). I slike situasjoner er det aktuelt å benytte legemidler som hemmer immunsystemet (immunsuppressiva). Se immunsuppressiv behandling. Se også immunitet og immunologi.